武汉疫情肆虐华夏，给中华大地造成了不可估量的损失，中国足球自然也难逃劫难。在疫情的影响下，包括中超、亚冠甚至国字号球队都将遭受巨大的打击。即使疫情能够在3月份得到控制，那么中超球队也会在4、5月份迎来极为密集的赛程。更严重的是，它还将影响到国足世预赛以及女足奥预赛的备战。针对上述问题，中国足协需要找到最合理的方法，以应对严重的疫情。
2020赛季中超联赛原定于2月22日正式开战，不过由于武汉疫情愈演愈烈，各家俱乐部的备战计划都被打乱。以上海申花为例，1月底的局势使得全队选择先从海口返回上海，并第一时间定了2月2日晚飞往澳大利亚珀斯的航班。但就在球队即将出征的前一天，澳当局颁布了限制中国公民入境的公告，行程再一次被打乱。无奈之下，球队前往迪拜继续冬训。但由于航班预定困难，申花全队先飞到了阿布扎比，再乘坐大巴车去到迪拜。
北京国安则是在结束了西班牙的第一阶段冬训后，原计划从1月28日开始在上海进行为期10天的集训。但迫于国内的疫情问题，国安临时将集训地点改在了韩国济州岛。天津泰达泰国海外拉练应于2月17日结束，18日回国，然后前往比较温暖的地方进行最后准备工作。因疫情原因，泰达方面决定延长在泰国的拉练时间，完成在曼谷的训练计划后，队伍前往另外的城市进行下一阶段训练。
针对武汉疫情，亚足联和中国足协也适时做出了赛程调整。1月29日，亚足联宣布中超球队亚冠前三轮比赛均调整为客场；1月30日，中国足协下发通知，国内各类足球赛事全部延期；2月4日，亚足联再度对亚冠赛程做出调整，推迟了中超球队亚冠前三轮的所有比赛。不过赛程的调整并不能保证球员们的状态，此外对于俱乐部的外援引进工作也造成了严重的影响。本赛季中超联赛实施限薪令，再加上疫情的影响，使得优秀外援的引进难上加难。
一方面是优秀外援难以引进，另一方面是大牌外援面临流失。恒大中场核心保利尼奥一再表示，因为疫情原因自己的确考虑过离开中国。富力前锋萨巴也明确表示，如果联赛一直不开始，他会要求外租。此外，中超的两位招牌外援卡拉斯科和伊哈洛已经离开中国。大连一方前锋卡拉斯科已经租借回到了西甲劲旅马竞，申花的尼日利亚前锋伊哈洛也以租借的形式加盟了英超豪门曼联。此外，据报道包括费莱尼、登贝莱、亚亚-图雷等大牌球员都提出了转会要求，只是最终未能成行
亚冠层面，亚足联于2月4日再度对亚冠赛程做出调整，推迟了中超球队亚冠前三轮的所有比赛，比赛集中到四五月份进行，这也意味着中超四强在短短两个月时间里，至少参加14场比赛。在没有疫情的影响下，不仅是时间不会紧凑，而且最的也就是13场比赛。虽然看起来就是多了一场比赛，但事实情况却没有这么简单，因为亚冠赛强度和国内比赛完全不是一个概念。面对如此密集的赛场，双线出击的中超BIG4可谓是苦不堪言。
相比疫情对于中超和亚冠的影响，其对国字号球队的影响无疑更大。以中国男足为例，原本在40强赛后半程的四个比赛日中还有三个主场，形势对男足很有利。可是因为武汉疫情原因，保守估计，中国男足至少失掉一个主场优势，甚至还不能排除失掉全部主场。国足原定于3月26日主场迎战马尔代夫队，但受疫情影响，很可能放在第三方泰国比赛。如果国足不能在主场迎战马尔代夫，那么31日与关岛比赛，国足还是很大概率不能拥有主场优势。
尽管国足在此前的小组赛中不敌叙利亚队，但是排名小组第二的他们依然有机会杀入12强赛。根据赛制，国足还有很好的机会争取以成绩最好的四个(或五个)的第二名之一的身份晋级12强赛。不过在失去了主场优势后，本就出线形势严峻的国足无疑雪上加霜。由此可见，如果能够在3月除把疫情控制住（如果在比赛开始前21 天，国足所在的主场城市不能具备举办比赛的公共卫生条件，那可能就要重新选择第三国进行比赛），还是有望在主场比赛的。
同样备战2020东京奥运会资格赛的中国女足也受到了疫情的影响，出于安全考虑，中国女足在达到澳大利亚后就遭遇了隔离的待遇。此外，球队头号核心、武汉籍球员王霜更是无缘资格赛。在隔离期间，球队无法进行系统性的训练，直到2月6日，女足姑娘们才结束了隔离期，而这个时间距离与泰国女足的首场比赛只有一天。不过争气的姑娘们在小组赛先后大胜泰国和中国台北，最后一轮将与澳大利亚女足争夺头名。
根据赛制，本届女足奥预赛分为4个阶段，获得前2名的球队以及东道主日本将代表亚洲参加东京奥运会女足项目比赛。中国女足直接入围第3阶段比赛，第3阶段分为2个小组，每组4支球队，小组前2名进行交叉半决赛，两回合比赛的胜者将获得东京奥运会入场券。中国女足被分在B组，同组球队包括澳大利亚、中国台北、泰国。A组中的前两名为韩国女足和越南女足，如果中国女足能够获得小组头名，那么获得奥运会名额的几率将非常大。
为了保障中超各俱乐部以及国字号球队的利益，中国足协已正式组建了“国际参赛应急保障组”，为亚冠参赛各俱乐部、国字号男女各级球队提供出境手续办理、竞赛组织与后勤保障、检疫协助等一系列服务。而在2月8日晚，中国足协以秘书长刘奕的名义分别向恒大、国安、上港和申花4家俱乐部发去了相关信息的函件，建议各家积极做好赛程协调、球员注册、国家队训练比赛配合工作，并在不可抗力的极端情况下，提前为亚冠赛事备好第三方中立场地。
